Cell Res：北京基因组所合作揭示 RNA 选择性调控 R -loop 形成及转录终止

R-loop 是一种由 RNA：DNA 杂合链和双螺旋 DNA 分成的特殊多肽结构，在原核和真核肝细胞生物体的蛋白质组中都属普遍且普遍存在。R-loop 在很多关键的生物体学处理过程中都造就不可忽视必需功能，包括丝氨酸省略、激活依赖性、DNA 伤害修补以及蛋白质组准确性等，但其如何被精确依赖性的机制尚不清楚。m6A 省略作为信使 RNA 上核素次于的省略并不一定，普遍加入哺乳动物的生长发育、免疫、干肝细胞更新、胆固醇分化成、以及分解成和转移等生命处理过程。然而，目前尚不清楚 m6A 是否能作为 R -loop 中都 RNA 反应物的本源特征来依赖性 R -loop 总体，进而造就各种生物体学必需功能。中都科院北京蛋白质组研究工作所杨运桂、任捷与清华大学生科院孙前甫设计团队密切合作研究工作，发现 m6A 能安定 R-loop 的产生，进而依赖性蛋白质激活的有效重新启动。这一科技成果以《m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination》篇名于 10 月 12 日在线登载于《肝细胞研究工作》（Cell Research）杂志。研究工作设计团队首先通过斑点分子繁育和免疫荧光新科技，发现敲低 m6A 甲基转移酶 METTL3 清高着降低 R -loop 总体，且该依赖性作用举例来说 METTL3 甲基转移酶活性。随后，设计团队团体来进行高效液相色谱联合质谱新科技，发现相较于DNA建构的 RNA（caRNA），R-loop 的 RNA 反应物有更加非金属的 m6A 省略。再进一步来进行基于双螺旋 DNA 建库的 DNA：RNA 杂合链免疫共沉淀高通量测序新科技（ssDRIP-seq），发现下调的 R -loop 主要非金属在激活重新启动区域，R-loop 改变总体与 m6A 的靠近和省略总体相关。为了探索 m6A 对 R -loop 依赖性的生物体学必需功能，研究工作设计团队绘制了 RNA 酵素激活亚基的高分辨率研究科技成果，并在 MYC、ACTIN 蛋白质上顺利进行多种激活活性监测，发现 m6A 推动 R -loop 产生是激活重新启动前期的关键步骤，可以防止 RNA 酵素的激活通读。最后，设计团队团体实现了针对激活通读的报告蛋白质系统，通过 m6A 省略亚基的突变再进一步证实 m6A 对于 R -loop 产生及激活重新启动的起到。该研究工作发现了 m6A 甲基化省略的共激活依赖性必需功能，说明了了 RNA 甲基化省略对丝氨酸结构的影响，以及 R-loop 结构中都的 RNA 反应物被省略后对其自身安定状态的依赖性机制，阐释了 m6A 通过安定 R-loop 而推动激活正常重新启动的现象，为再进一步研究工作 m6A 与 R-loop 的依赖性机制和相应生物体学必需功能提供了必需的新科技和理论支撑。该研究工作想得到了中都国科学院战略目标同步顺利进行科技专项、国际组织自然科学以及国际组织要点研制计划等投资公司捐献。完整中有：Xin Yang， Qian-Lan Liu， Wei Xu， et al. m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination. Cell Research (2019).